بررسی تنوع ژنتیکی برخی از جدایه‌های قارچ Macrophomina phaseolina با استفاده از نشانگر‌های مولکولی PCR-RFLP و RAPD

پوسیدگی ذغالی با عامل Macrophomina phaseolina یکی از بیمار‎یهای مهم اقتصادی می‎باشد که سبب کاهش عملکرد در گیاهان زراعی و باغی می‎شود. تعداد 33 جدایه از قارچ M. phaseolina بدست آمده از میزبان‌های متفاوت مانند سویا، خربزه، لوبیا، نخود، کاج، کوکب‎کوهی، کیوی، پنبه و کنجد جمع‌آوری شدند. شدت بیماریزایی جدایه‎ها روی بذور خربزه در شرایط آزمایشگاه ارزیابی شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌ها از نشانگرهای مولکولی RAPD و PCR-RFLP استفاده شد. تکثیر نواحی ITS با استفاده از آغازگر‌های ITS5 و LR5 تنها یک قطعه DNA 1600 جفت بازی را تولید کرد. نتایج نشان داد که با کاربرد نشانگر‎های RAPD تنوع ژنتیکی بین جدایه‎ها وجود دارد. داده‌های RAPD بر اساس پنج آغازگر تصادفی در 16 جدایه، درجه بالایی از چندشکلی را در جدایه‌های مختلف نشان دادند. دندروگرام به روش UPGMA که با داده‎های RAPD رسم شد، نه گروه در سطح شباهت 70 درصد ایجاد کرد. جدایه‌های که از مناطق مشابه بودند تمایل به گروه‎های نزدیک را داشته که نشان دادند که از نظر ژنتیکی به هم مرتبط‌اند.